Der Geruch könnte durchaus daher kommen. Das Zittern und Kauern klingt wirklich nicht gut. Ich befürchte das sie immer noch unter Schmerzen durch die Entzündung leidet.
Bezüglich des Futters würde ich wirklich überlegen mich an Fachtierärzte zu wenden. Die Uni München ist bezüglich Futterberatung recht bekannt https://www.ernaehrung.vetmed.…atung/eb_hunde/index.html